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施一公團隊解析出超復(fù)雜蛋白結(jié)構(gòu)

  • 2018年8月14日 FanTianQing來源:新浪網(wǎng) 1412 93
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8月10日,《科學(xué)》雜志在線刊發(fā)施一公團隊研究成果,首次解析了人源多囊蛋白1與多囊蛋白2形成的復(fù)合物的結(jié)構(gòu),分辨率達到3.6Å(埃,相當(dāng)于10-10米)。


螞蟻搬家,“反推”出高精度三維結(jié)構(gòu)

冷凍電鏡通過發(fā)射電子、并測定電子通過蛋白質(zhì)分子后軌跡變化的方式,達到蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)A級精度地呈現(xiàn)。其每次掃描的視域非常狹小。因此,蛋白“上鏡”后,需要長時間運轉(zhuǎn)和巨量信息處理。對于超大結(jié)構(gòu)的蛋白質(zhì)來說,研究者將收集到倍數(shù)增加的大量數(shù)據(jù),再通過計算進行結(jié)構(gòu)的再現(xiàn)。

整個蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu)的成型猶如螞蟻搬家,在獲得大量多角度二維圖片后,由后期的三維重建系統(tǒng)對圖片數(shù)據(jù)進行計算和重構(gòu),并通過可視化系統(tǒng)形成蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu)的示意圖。

通過冷凍電鏡掃描,施一公團隊獲得了多囊蛋白1和多囊蛋白2形成的獨特一比三復(fù)合物結(jié)構(gòu),并對該結(jié)構(gòu)和生化數(shù)據(jù)進行了進一步分析。

“面目”清晰,提出多囊腎發(fā)病機制新觀點

蛋白復(fù)合物的清晰面目為假說給出了“鐵證”或“反證”。研究團隊發(fā)現(xiàn)了與當(dāng)下主流學(xué)術(shù)觀點相悖的多個現(xiàn)象。論文第一作者宿強解釋,“多囊腎研究領(lǐng)域內(nèi)對這兩個蛋白是否形成鈣離子通道一直存有爭議,解析結(jié)構(gòu)不支持復(fù)合物為鈣離子通道的假說?!?/p>

該復(fù)合物結(jié)構(gòu)也刷新了結(jié)構(gòu)生物學(xué)家對電壓門控離子通道類似折疊“長相”的認(rèn)識。之前報道的大多數(shù)離子通道類似折疊結(jié)構(gòu)或者是同源四聚體,或者是單鏈的假四次對稱體,這個卻是兩個蛋白組成的一比三的復(fù)合物。

“有意思的是,其中一個蛋白自己單獨也能形成四聚體。這種獨特的結(jié)構(gòu)意味著不同的工作機理和調(diào)控方式,豐富了結(jié)構(gòu)生物學(xué)家對電壓門控離子通道類似折疊蛋白組裝的理解?!彼迯娬f。

15年前“出題”的論文中猜測多囊蛋白1和多囊蛋白2的“協(xié)作”模式有4種,隨著結(jié)構(gòu)的清晰,這些假設(shè)將很快有明確答案,給多囊腎病的機制研究帶來有益的參考。

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多囊腎又名Potter(Ⅰ)綜合征、Perlmann綜合征、先天性腎囊腫瘤病、囊胞腎、雙側(cè)腎發(fā)育不全綜合征、腎臟良性多房性囊瘤、多囊病。我國1941年朱憲彝首先報道,本病臨床并不少見。多囊腎有兩種類型,常染色體隱性遺傳型(嬰兒型)多囊腎,發(fā)病于嬰兒期,臨床較罕見;常染色體顯性遺傳型(成年型)多囊腎,常于青中年時期被發(fā)現(xiàn),也可在任何年齡發(fā)病。

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