深圳大學(xué)光電學(xué)院近日宣布,該院牛憨笨院士團(tuán)隊聯(lián)合清華大學(xué)、哲源科技、香港大學(xué)、檸檬數(shù)據(jù)、美國得州大學(xué)達(dá)拉斯分校等機(jī)構(gòu)研究人員,這是迄今為止在細(xì)胞核中直接觀察到的最短特異DNA序列的圖像,相關(guān)工作最近發(fā)表于國際高水平開放雜志eLife上。
來自清華大學(xué)和得州大學(xué)達(dá)拉斯分校的共同通訊作者張奇?zhèn)ソ淌诮榻B,傳統(tǒng)的FISH方法受限于各種因素(包括標(biāo)記能力和光學(xué)分辨率)而難以獲得基因組中特定短片段的清晰微觀圖像。
“雖然這種技術(shù)在染色質(zhì)結(jié)構(gòu)域精細(xì)組織方式研究很有前景,但我們希望能夠研究發(fā)展一種新方法: 不但進(jìn)一步提高基因組序列分辨率,重要的是,避免繁瑣的探針制備過程對實際應(yīng)用的限制”,張奇?zhèn)ソ淌诮榻B說,這種新方法能精確地靶向基因增強(qiáng)子和啟動子,使其相互作用,原位可視化,同時可用來檢測癌癥和其他疾病中單細(xì)胞內(nèi)特定DNA小片段及其之間相互作用的變化。
論文作者之一、深圳大學(xué)曹博博士介紹,在自主搭建的三維隨機(jī)光學(xué)重建顯微鏡(3D-STORM)平臺上,他們采用了分子信標(biāo)(MB)探針的這一新方法(MB-FISH),能夠在納米分辨條件下展現(xiàn)目標(biāo)DNA小片段在細(xì)胞核內(nèi)三維空間的分布,這種能力類似于在擁擠的超過100萬人的大廳中精確識別出想要找的那個人。
據(jù)介紹,目前,該團(tuán)隊開始搭建和完善多色3D-STORM,該系統(tǒng)升級后,將會在研究人類正常和疾?。ū热绨┌Y)細(xì)胞中3D基因組結(jié)構(gòu)功能方面釋放更大的潛力。
參與相關(guān)工作的深圳大學(xué)光電學(xué)院的青年學(xué)者均系該院牛憨笨院士團(tuán)隊成員。1997年當(dāng)選為中國工程院院士的牛憨笨是我國杰出的光電子學(xué)和超快診斷技術(shù)專家, 1999年,他帶領(lǐng)自己的科研團(tuán)隊加盟深圳大學(xué),成為深圳大學(xué)引進(jìn)的首位院士。
2016年7月,牛憨笨院士因病逝世。深圳大學(xué)光電學(xué)院院長屈樂軍表示,牛憨笨院士生前一直致力于先進(jìn)光學(xué)方法的創(chuàng)新,同時積極推進(jìn)光學(xué)方法在生命科學(xué)中的應(yīng)用。此次成果的發(fā)布,是對牛憨笨院士最好的紀(jì)念。
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